亚急性甲状腺炎没有特异性的治疗方法，治疗的目的在于消除症状和纠正甲状腺功能异常状态。因此，症状轻微者不需要特殊处理。症状较重者，适当休息，给予水杨酸制剂或非甾体消炎药口服治疗。阿司匹林0·5～1．0或吲哚美幸(消炎痛)25mg，每日3～4次。通常，甲状腺疼痛完全缓解约需3～4周，甲状腺肿大消失约需7-10周。疼痛缓解后开始逐渐减量，具体疗程视疼痛和肿大是否缓解而定。在甲状腺触诊转为阴性，超声显示回声低减区基本消失时可以停药。也可以先用阿司匹林0．5～1．0g，每4h一次，常可缓解颈部疼痛和触痛，48h内无效，可给予非甾体消炎药。尚无证据证明非甾体消炎药的效果一定好于水杨酸。

　　全身症状较重，持续高热，甲状腺明显肿大，触压痛显著者，经水杨酸制剂或非甾体消炎药治疗24～48h无效时，需要用皮质类固醇治疗。这类患者约占亚急性甲状腺炎的5％。泼尼松每天20～40rag，视病情和患者体重大小而定。健壮的男性所需要的剂量较大。常可在数小时内缓解疼痛症状。在减量过程中，减量过快常可使疼痛复发。可以
按以下方法减少药量：甲状腺疼痛消失、触诊转变为阴性(此时，超声可显示受累甲状腺回声低减区缩小)，可开始减少泼尼松5～10rag。以后如果无病情反复，可每周减少泼尼松5～2．5rag。维持2～3个月。超声复查显示回声低减区基本消失，代之以高回声光点时停药。也可以选择在甲状腺摄131I率恢复正常时停药。

　　如果泼尼松治疗无效，就需要重新考虑诊断是否正确。严重的反复发作疼痛的亚急性甲状腺炎，当其他治疗均无效时，偶尔可以考虑手术切除之。甲亢症状突出者，应予以p受体阻滞剂治疗。此时，抗甲亢药或放射性碘治疗均无效且有可能会加重病情。甲减期短暂而且常无症状，通常不必要使用甲状腺激素替代治疗。此外，在甲减期内，rSH升高可能有利于甲状腺功能的恢复。因此，除非患者甲减症状十分明显，否则，不应该使用甲状腺激素。也有人认为在甲减期使用甲状腺激素可消除甲状腺肿大和减轻甲状腺包膜张力。因此，关键是掌握好甲状腺激素替代治疗的时机。